Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SspnQ62147 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SspnQ62147 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SspnQ62147 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SspnQ62147 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SspnQ62147 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SspnQ62147 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SspnQ62147 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SspnQ62147 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SspnQ62147 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SspnQ62147 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SspnQ62147 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SspnQ62147 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SspnQ62147 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SspnQ62147 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SspnQ62147 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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