Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sin3bQ62141 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sin3bQ62141 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms