Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms