Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Itga7Q61738 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga7Q61738 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms