Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AtrxQ61687 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms