Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd2Q61285 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd2Q61285 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd2Q61285 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd2Q61285 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd2Q61285 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd2Q61285 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd2Q61285 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd2Q61285 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd2Q61285 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd2Q61285 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd2Q61285 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd2Q61285 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd2Q61285 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd2Q61285 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd2Q61285 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd2Q61285 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd2Q61285 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd2Q61285 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd2Q61285 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd2Q61285 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd2Q61285 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd2Q61285 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcd2Q61285 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcd2Q61285 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcd2Q61285 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcd2Q61285 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcd2Q61285 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcd2Q61285 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcd2Q61285 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcd2Q61285 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcd2Q61285 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcd2Q61285 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcd2Q61285 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd2Q61285 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.7 ms