Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
AcanQ61282 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AcanQ61282 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AcanQ61282 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AcanQ61282 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AcanQ61282 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AcanQ61282 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AcanQ61282 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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