Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lamb3Q61087 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms