Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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