Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3Q60803 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms