Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klf4Q60793 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms