Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samhd1Q60710 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms