Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpbQ60649 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms