Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CttnQ60598 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CttnQ60598 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CttnQ60598 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CttnQ60598 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CttnQ60598 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CttnQ60598 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms