Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms