Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms