Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tdrd5Q5VCS6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms