Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D9

Thoc6, THO complex subunit 6 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc6Q5U4D9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc6Q5U4D9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc6Q5U4D9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc6Q5U4D9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc6Q5U4D9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc6Q5U4D9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc6Q5U4D9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc6Q5U4D9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc6Q5U4D9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc6Q5U4D9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc6Q5U4D9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc6Q5U4D9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc6Q5U4D9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc6Q5U4D9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc6Q5U4D9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc6Q5U4D9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc6Q5U4D9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc6Q5U4D9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc6Q5U4D9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc6Q5U4D9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc6Q5U4D9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc6Q5U4D9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc6Q5U4D9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc6Q5U4D9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc6Q5U4D9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc6Q5U4D9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc6Q5U4D9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc6Q5U4D9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thoc6Q5U4D9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thoc6Q5U4D9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thoc6Q5U4D9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thoc6Q5U4D9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thoc6Q5U4D9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Thoc6Q5U4D9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thoc6Q5U4D9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thoc6Q5U4D9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thoc6Q5U4D9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thoc6Q5U4D9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms