Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms