Protein–RNA interactions for Protein: Q5U406

Zfp78, Zinc finger protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp78Q5U406 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp78Q5U406 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms