Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Vmn1r196Q5SVD5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Vmn1r196Q5SVD5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Vmn1r196Q5SVD5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Vmn1r196Q5SVD5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Vmn1r196Q5SVD5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Vmn1r196Q5SVD5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Vmn1r196Q5SVD5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Vmn1r196Q5SVD5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Vmn1r196Q5SVD5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Vmn1r196Q5SVD5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Vmn1r196Q5SVD5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Vmn1r196Q5SVD5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Vmn1r196Q5SVD5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Vmn1r196Q5SVD5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Vmn1r196Q5SVD5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Vmn1r196Q5SVD5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Vmn1r196Q5SVD5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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