Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD0

Rflnb, Refilin-B, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RflnbQ5SVD0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RflnbQ5SVD0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms