Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I8

Trav3-1, T cell receptor alpha variable 3-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav3-1Q5R1I8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trav3-1Q5R1I8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms