Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms