Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms