Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Nlrc3Q5DU56 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Nlrc3Q5DU56 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Nlrc3Q5DU56 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc3Q5DU56 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms