Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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