Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
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Rtl5Q5DTT4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
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Rtl5Q5DTT4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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Rtl5Q5DTT4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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Rtl5Q5DTT4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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Rtl5Q5DTT4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
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Rtl5Q5DTT4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
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Rtl5Q5DTT4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
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Rtl5Q5DTT4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
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Rtl5Q5DTT4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rtl5Q5DTT4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
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Rtl5Q5DTT4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
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Rtl5Q5DTT4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
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Rtl5Q5DTT4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
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Rtl5Q5DTT4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
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Rtl5Q5DTT4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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Rtl5Q5DTT4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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Rtl5Q5DTT4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtl5Q5DTT4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
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