Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fam208bQ5DTT3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam208bQ5DTT3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam208bQ5DTT3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam208bQ5DTT3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam208bQ5DTT3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam208bQ5DTT3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam208bQ5DTT3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam208bQ5DTT3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fam208bQ5DTT3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam208bQ5DTT3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms