Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms