Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA7

Snx33, Sorting nexin-33, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx33Q4VAA7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx33Q4VAA7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx33Q4VAA7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms