Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin28bQ45KJ6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28bQ45KJ6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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