Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc110Q3V125 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms