Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms