Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Dnah12Q3V0Q1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Dnah12Q3V0Q1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnah12Q3V0Q1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms