Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc43Q3V0L5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms