Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
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Kdm5aQ3UXZ9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kdm5aQ3UXZ9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
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Kdm5aQ3UXZ9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms