Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mbd3l2Q3UXB0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mbd3l2Q3UXB0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms