Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E330034G19RikQ3UWX6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms