Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTY6

Thsd4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd4Q3UTY6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms