Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B230104I21RikQ3USW4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms