Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Gm5460Q3UQ97 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Gm5460Q3UQ97 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Gm5460Q3UQ97 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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