Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmem253Q3UNB8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms