Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms