Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitpnm3Q3UHE1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.7 ms