Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms