Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LbrQ3U9G9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LbrQ3U9G9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LbrQ3U9G9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LbrQ3U9G9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LbrQ3U9G9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LbrQ3U9G9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LbrQ3U9G9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LbrQ3U9G9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LbrQ3U9G9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LbrQ3U9G9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LbrQ3U9G9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LbrQ3U9G9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LbrQ3U9G9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LbrQ3U9G9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LbrQ3U9G9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LbrQ3U9G9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LbrQ3U9G9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LbrQ3U9G9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LbrQ3U9G9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LbrQ3U9G9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LbrQ3U9G9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LbrQ3U9G9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LbrQ3U9G9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LbrQ3U9G9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LbrQ3U9G9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms