Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VwceQ3U515 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms