Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hectd3Q3U487 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hectd3Q3U487 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms