Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms